Кинетические и равновесные параметры взаимодействия лигандов с клеточными рецепторами в условиях неравновесного и кооперативного связывания

  • Автор:
  • Специальность ВАК РФ: 03.00.04
  • Научная степень: Кандидатская
  • Год защиты: 1999
  • Место защиты: Москва
  • Количество страниц: 152 с. : ил.
  • Стоимость: 250 руб.
Титульный лист Кинетические и равновесные параметры взаимодействия лигандов с клеточными рецепторами в условиях неравновесного и кооперативного связывания
Оглавление Кинетические и равновесные параметры взаимодействия лигандов с клеточными рецепторами в условиях неравновесного и кооперативного связывания
Содержание Кинетические и равновесные параметры взаимодействия лигандов с клеточными рецепторами в условиях неравновесного и кооперативного связывания
СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННЫХ СОКРАЩЕНИЙ
БАС — боковой амиотрофический склероз кл — клетка (клеток)
JIPB — лиганд-рецепторное взаимодействие
ОР — опиоидные рецепторы
СКО — среднеквадратичное отклонение
PPM — радиорецепторный метод
ФРН — фактор роста нервов
DAGO — [D-Ala2, N-Me-Phe4, Gly-ol5]-энкефалин DADLE — [D-Ala2,D-Leu5]-энкефалин GTP - гуанозинтрифосфат
Глава 1. Основные модели лиганд-рецепторного взаимодействия. Дискриминация моделей рецепторного связывания
1.1. Основные модели лиганд-рецепторного взаимодействия
1.1.1. Простейшая модель лиганд-рецепторного взаимодействия
1.1.2. Взаимодействие одного лиганда с несколькими типами мест связывания
1.1.3. Взаимодействие нескольких лигандов с одним типом рецепторов
1.1.4. Кооперативное лиганд-рецепторное взаимодействие
1.1.5. Более сложные модели лиганд-рецепторного взаимодействия
1.1.6. Диффузия лиганда. Модель биофазы
1.2. Графические методы определения концентрации рецепторов и их аффинности
1.2.1. Анализ результатов кинетических экспериментов
1.2.2. Распределение ошибок по связыванию и диссоциации
1.2.3. Разграничение процессов рецепции, транспорта и деградации лигандов
1.2.4. Применение методов преобразования координат для анализа результатов кинетических экспериментов
1.2.5. Анализ результатов экспериментов по связыванию в равновесных условиях
1.2.6. Определение аффинности рецепторов
1.3. Применение методов оптимизации для определения параметров связывания и дискриминации моделей
Глава 2. Определение условий применения методов оптимизации для определения концентрации рецепторов и их аФбинности
Предложенная в гл.1 процедура определения концентрации рецепторов и их аффинности позволяет решать поставленную задачу даже при неравновесном или кооперативном связывании. При этом для минимизации функционала (1) используется закон действующих масс (вычисление величины [Ш^т ) . Однако данный закон, также как и законы радиоактивного распада (Гольданский и соавт., 1959; Ватутин и соавт., 1985), начала термодинамики (Кикоин, Кикоин, 1963; Ландау, Лившиц, 1976), имеет статистический характер, т.е. при большом числе наблюдений он выполняется с вероятностью, близкой к единице. Между тем, в последние годы наметился прогресс в изучении действия малых (10~14-10~16 М) и сверхмалых (10~16 М и ниже) доз различных веществ (Сазонов, Зайцев, 1992). В этих условиях наблюдается взаимодействие единичных молекул лиганда с единичными молекулами рецепторов, т.е. очевидно, что закон действующих масс неприменим для описания системы "лиганд-рецептор" и разработанные нами в гл. 1 методы определения концентрации рецепторов и их аффинности не могут быть использованы.
Поэтому на следующем этапе исследования были получены критерия выбора детерминистической или стохастической (вероятностной) модели для описания ЛРВ для заданных условий. Для решения данной задачи были рассчитаны математическое ожидание и дисперсия числа лиганд-рецепторных комплексов для каждой модели ЛРВ (см. ниже). Расчеты делались с помощью дифференциального уравнения для процесса гибели и размножения (Гуревич, Матвеев [в печати]):

Рекомендуемые диссертации данного раздела