Микробные сообщества щелочных гидротерм

От' ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1.1. Характеристика основных типов щелочных гидротерм
1.1.1. Основные типы щелочных гидротерм
1.1.2. Свойства щелочных термальных вод
1.2. Распространение и состав микробных сообществ в зависимости
от физико-химических факторов среды
1.2.1. Микробные сообщества щелочных гидротерм
1.2.2. Микробные сообщества нейтральных гидротерм
1.3. Активности продукционных и терминальных деструкционных

процессов в фототрофных и хемотрофных микробных сообществах гидротерм
1.3.1 Микробные сообщества щелочных гидротерм
1.3.2. Микробные сообщества нейтральных гидротерм
1.4. Экофизиология термофильных микроорганизмов щелочных гидротерм
1.4.1. Температурные и pH границы развития микроорганизмов
1.4.2. Микроорганизмы - первичные продуценты
1.4.3. Микроорганизмы-деструкторы
1.5. Участие микробного сообщества щелочных гидротерм в
минералообразовании
ЗАКЛЮЧЕНИЕ ПО ОБЗОРУ ЛИТЕРАТУРЫ. Задачи работы
ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ '
2. Объекты и методы исследования
2.1. Объекты исследования
2.2. Методы полевых исследований
2.3. Методы лабораторных исследований
2.3.1. Методы культивирования и изучения роста бактерий в
зависимости от физико-химических факторов
^ 2.3.2. Методы электронной микроскопии
2.3.3. Методы гено- и хемосистематики
2.3.4. Методы определения скорости микробных процессов
2.3.5. Методы определения содержания пигментов в микробных матах
РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ
3. Исследование микробных сообществ щелочных гидротерм
3.1. Гаргинский источник
3.1.1. Распространение и видовой состав микробных сообществ
в связи с изменением физико-химических условий среды
3.1.2. Биогеохимическая активность.
3.2. Уринский источник
3.2.1. Распространение и видовой состав микробных сообществ
в связи с изменением физико-химических условий среды
3.2.2. Биогеохимическая активность.
3.3. Сеюйский источник ’
3.3.1. Распространение и видовой состав микробных сообществ
в связи с изменением физико-химических условий среды
3.3.2. Биогеохимическая активность
3.4. Аллинский источник '
3.4.1. Распространение и видовой состав микробных сообществ
в связи с изменением физико-химических условий среды
3.4.2. Биогеохимическая активность.
3.5. Большереченский источник
3.5.1. Распространение и видовой состав микробных сообществ
в связи с изменением физико-химических условий среды
3.5.2. Биогеохимическая активность.
3.5.3. Влияние температуры и pH на микробное сообщество
3.6. Источник “Паоха” (Моно Лейк)
3.6.1. Распространение и видовой состав микробных сообществ
в связи с изменением физико-химических условий среды
3.6.2. Биогеохимическая активность.
3.7. Биогенное минералообразование в микробных матах
щелочных термальных источников
4. Исследование чистых культур, выделенных из микробных
сообществ щелочных гидротерм
4.1 Термофильная аноксигенная фототрофная бактерия
Chloroflexus aurantiacus
4.1.1 Морфология и ультраструктура.

4.1.2. Пигменты.
4.1.3. Физиология.
4.1.4. Генотипические свойства и филогенетическое положение.
4.2. Органотрофная аэробная термофильная бактерия
4.3 Термофильные сульфатредуцирующие бактерии
4.4. Алкалотермофильная органотрофная бактерия “АпаегоЬгапса саЩогпіетіз"
4.4.1. Морфология и ультраструктура
4.4.2. Физиологические характеристики.
4.4.3. Г енотипические свойства и филогенетическое положение.
4.4.4. Диагноз вида АпаегоЬгапса саіі/огпіетія
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
клетки Chloroflexus aggregans более толстые (до 1.5 мкм), скорость скольжения нитей по поверхности примерно в 100 раз выше, есть способность к быстрому образованию Ш аггрегатов в жидкой среде (за 20-30 минут), не способен к использованию ацетата,
цитрата, этанола и глицил-глицина (Hanada et al., 1995b). Roseiflexus castenholzii не обладает хлоросомами и бактериохлорофиллом с и содержит только бактериохлорофилл а (Hanada et al., 2002).
ХемолитоавтоттюсЬные алкалотепмофильньте и алкалотолепантные
микроорганизмы. Хемолитоавтотрофные алкалотермофильные микроорганизмы в настоящее время не известны (Кевбрин, личное сообщение; Wiegel, 1998). Единственным известным хемолитоавтотрофным термофильным алкалотолерантным организмом является метаногенная археобактерия Methanolhermöbacter thermoautotrophicum (ранее Methanobacterium thermoautotrophicum, синоним М. thermoalcaliphilum) способная существовать при pH 9 и обладающая оптимумом pH 7.7.-7.8 (Zeikus, Wolfe, 1980; Blotevogel et al., 1986).
^ 1.4.3. Микроорганизмы—деструкторы
Аэробные и факультативно аэробные органотпосЬные микроорганизмы. Валидно опубликованные алкалофильные термофильные аэробные микроорганизмы в настоящее время не известны. Недавно Мартинссон с соавторами обнаружили в щелочных субаквальных гидротермах Эйджафьордур аэробные органторофные микроорганизмы способные существовать в лабораторных условиях при pH 10 и температуре 60-72°С. По результатам анализа 16S-pPHK (на основании анализа 400-500 пар нуклеотидов, сходство 95-99%) изоляты были отнесены к видам Geobacillus thermoleovorans, “G. caldotenax", G. flavothermus, G. caldovelox (Marteinsson et al., 2001). Тем не менее, типовые штаммы данных организмов не способны расти при pH выше 8 (Назина, Григорьян - личное сообщение).
Известные микроорганизмы являются либо «самыми “алкалофильными” среди термофилов, либо самыми “термофильными” среди алкалофилов» (Wiegel, 1998).-►д Оптимумом pH выше 8.5 обладает Bacillus sp. штамм 221, способный расти до pH 10 и
максимальной температурой роста 57°С, являющийся алкалофилом, но не термофилом (Horikoshi, 1990, Wiegel, 1998). Среди термофильных микроорганизмов известен ряд аэробных алкалотолерантных бактерий (архебактерии неизвестны). Это представители