Аноксигенные фототрофные бактерии содовых озер Юго-Восточного Забайкалья

ОГЛАВЛЕНИЕ
ВВЕДЕНИЕ
ЛИТЕРАТУРНЫЙ ОБЗОР
ГлаваГ СОВРЕМЕННЫЕ ПРЕДСТАВЛЕНИЯ О ФИЛОГЕНИИ,
ТАКСОНОМИИ И ФИЗИОЛОГИИ АФБ . .
1.1. Филогенетическое положение и современная систематика различных групп АФБ . . . . . .
1.2. Характеристика основных групп АФБ . .
1.2.1. Пурпурные бактерии . . . . . . .
1.2.2. Зеленые серобактерии . . . . . .
1.2.3. Зеленые нитчатые бактерии . . . .
1.2.4. Гелиобактсрии  . Г А .
1.2.5. Аэробные АФБ . . . .
1.3. Способность АФБ к экстремофилии . . . .
Глава 2. ПРИРОДНЫЕ ЩЕЛОЧНЫЕ СИСТЕМЫ . . .
2.1. Природные содовые воды . . . . . .
2.2. Механизмы формирования щелочных содовых озер . . .
2.3. Характеристика минеральных озер ЮгоВосточного
Забайкалья . . . . . . .
2.3.1. Физикогеографическая характеристика района . . .
2.3.2. Харакгеристика минеральных озер . . . .
2.4. Микробные сообщества содовых озер . . . . .
ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ
Глава 3. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ . .
3.1. Объекты исследований . . . . . . .
3.2. Методы полевых исследований . . . . . .
3.3. Методы лабораторных исследований . . . . .
3.3.1. Методы выделения и культивирования . .
3.3.2. Методы изучения морфологии и ультратонкого строения клеток 
3.3.3. Методы изучения пигментного состава клеток . . .
3.3.4. Методы изучения физиологии исследуемых микроорганизмов 
3.3.5. Методы изучения состава жирных кислот . . .
3.3.6. Методы изучения общих клеточных белков . . .
3.3.7. Методы генетических исследований . . .
РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ .
ГЛАВА 4. ФОТОТРОФНЫЕ СООБЩЕСТВА СОДОВЫХ ОЗЕР
ЮГОВОСТОЧНОГО ЗАБАЙКАЛЬЯ . . .
4.1. Физикохимическая характеристика озер . . .
4.2. Разнообразие фототрофных бактерий в исследованных озерах 
4.3. Отношение АФБ к , карбонату и ИаС1 . . .
Глава 5. ХАРАКТЕРИСТИКА НОВЫХ ВЫДЕЛЕННЫХ АФБ . . 
5.1. Характеристика новой алкалофильной пурпурной серобактерии ТИгю1орга яЬгса . поу., яр. поу. . . . .
5.2. Характеристика новой алкалофильной пурпурной серобактерии ТИоакасоссш шпеНсш . поу., Бр. поу. . . . .
5.3. Характеристика новых алкалофильных гелиобактерий обитателей содовых озер . . . . . . .
5.4. Характеристика новых гелиобактерий  обитателей термальных щелочных сульфидных источников . . . . 
ЗАКЛЮЧЕНИЕ 
ВЫВОДЫ.
ПРИМЕЧАНИЕ.
ЛИТЕРАТУРА


Эволюционное древо i, отражающее отделы культивируемых закрашенные лучи и некультивируемых бактерий   . Величина лучей отражает глубин ветвления представителей таксономических групп. Масштаб соответствует нуклеотидным заменам на каждые 0 нуклеотидов. Наибольшее количество АФБ найдено в классе i. Название i, как новый класс, было предложено для всех пурпурных бактерий и их хемофофных родственников   . Данный класс подразделяется на 5 подгрупп  а, 5, у, 6 и 8 ,    . Группа аэробных АФБ, объединяющая рода , , ii, , , iiii, , i, , , vi, i и ivivx относится к i. Согласно анализу  рДНК ее представители находятся в более близком родстве с хемотрофными бактериями аподгруппы, чем с другими фототрофами ПНБ   .  ii показывает определенное родство с i ii, ii ii и членами рода iiii.  ii,  и  являются очень близкородственными родами и относительно далеко удалены от других аэробных фототрофов, но более всего близки бактериям рода i v  .  iii находится в относительно близком филогенетическом родстве с ПНБ  i и   и хсмотрофной бактерией  iii   . v  ,  i  . vi  филогенетически близок родам , i, , i, i и    . Недавно выделенная новая аэробная АФБ   принадлежит к рi и наибольшее родство проявляет с бактериями родов  I и ix   . ПНБ, в отличие от ПСБ, являются чрезвычайно гетерогенной фуппой. Детальное изучение нуклеотидных последовательностей  рРНК позволило упорядочить их таксономию и придало ей филогенетическую направленность. Например, ныне признанные рода iii, vii, i и i раньше были объединены в один род ii, а некоторые представители vi относились к родам  и  I  . i  . Кроме того,   переклассифицирован в   iii  , 6,  i в i i iii  . ii  в i i i  . ПНБ принадлежат к а и ii и во многих случаях наибольшее сходство по результатам анализа  рДНК показывают с хемотрофными бактериями, чем между собой. К подгруппе относятся бактерии родов ii, , , ii, vii, i, i, ii, , iiv, i, i, i и i. Их ближайшими нефототрофными филогенетическими соседями в пределах подгруппы являются гасосгшгруппа, группа, ЛссТобасеггруппа, iiгруппа, iii ii, ii i, ii v, i ii и ii i   . Г1НБ рода  I  .  i , относятся к  i. Недавно  i, показывающий определенное специфическое родство с iixгруппой, перенесен в новый род как ivivx i i  . Также бактерии, известные ранее как  iнодобная группа iii  i,  описаны как новый род и вид x  iii  . Они также принадлежат к 3подгруппе и родственны хемотрофам рода    . ПСБ, представленные семействами i и ii, принадлежат к i. Согласно анализам  рДНК оба семейства образуют вполне различимые группы внутри у i   .   .