Актинобактерии: развитие систематики на примере семейств порядка Actinomycetales

ВВЕДЕНИЕ. 
Состояние вопроса и актуальность проблемы. 
Цель и задачи исследования 
Научная новизна работы 
Практическая значимость. 
Апробация работы 
Научные программы, в рамках которых выполнялись исследования и
связь с планом научноисследовательских работ Института 
ПУБЛИКАЦИИ 
БЛАГОДАРНОСТИ. 
ГЛАВА 1. Ранние системы классификации актиномицетов. 
1.1. Морфологические особенности основной критерий выделения
родов актиномицетов на начальном этапе развития системы группы 
1.2. Хемотаксономическое направление в систематике гг. XX в. 
ГЛАВА 2. Современная систематика актинобактерий основывается на
принципах полифазной таксономии 
2.1. Вид основная таксономическая единица бактериальной классификации 
2.2. Современные иерархические системы классификации актинобактерий 
2.3. Характеристики актинобактерий, используемые в современной систематике 
2.3.1. Морфологические, культуральные и физиологобиохимические признаки 
2.3.2. Хемотаксономические признаки 
2.3.3. Характеристики генома
ГЛАВА 3. Материалы и методы исследований. 
3.1. Объекты исследования. 
3.2. Методы 
3.2.1. Обработка образцов и посевы 
3.2.2. Методы изучения морфологических и культуральных признаков 
3.2.3. Методы изучения физиологобиохимических признаков 
3.2.4. Методы изучения хемотаксономическнх признаков. 
3.2.5. Молекулярнобиологические методы. 
ГЛАВА 4. Систематика актиномицетов рода i семейство
i. 
4.1. Род i входит в группу Корине и нокардиоформных актиномицетов. 
4.2. Видовой состав рода i новый вид Р. . 
4.3. Реклассификация Р. i ., как vi i. Г ЛАВА 5. Систематика актиномицетов семейства А ii. 
5.1. уточнение и дополнение диагноза рода. 
5.1.1. Предложение новых видов . , . i, ., . i 
5.2. i . v., . v. новые род и вид из древних многолетнемерзлых отложений. 
5.3. Уточнение границ и таксономической структуры рода vi. 
5.3.1. К истории систематики фитопатогенных бактерий рода vi 
5.3.2. Восстановление подвидов С iii в статусе видов 
5.3.3. vi . v., vi . v. и
vi . v. 
5.4. Новый род i и его видовой состав 
5.4.1. Новые комбинации . i, . iii, . ii 
5.4.2. Новые виды . и . ii. 
5.5. Изучение бактериоциногенных профилей штаммов родов
vi и i в таксономическом аспекте. 
5.6. Новый род ii и его видовой состав 
5.7. i дифференциация от i и уточнение диагноза рода 
5.7.1. Состав терминальных оксидаз дыхательной цепи как
хемотаксономическнй признак актинобактерий родов i
и i 
5.7.2. Три новых вида рода i . i . v., . i . v.
и . ii . v. I
5.8. Новый род i и видовой состав рода 
5.9. Новые род и вид ii i . v., . v. 
5 Новые род и вид ii iii. 
5 Род ii 
. ii v . v. 
5 Род i и его видовой состав. 
. Новый вид из галлов на растениях i
i . v. 
5 iii i . v. и уточнение диагноза рода iii. 
ГЛАВА 6. Систематика актиномицетов рода vii
семейство vii. 
6.1. Новые виды vii . v., В. i . v. и В i . v., характеризующиеся оранжевой окраской колоний 
ГЛАВА 7. Систематика актиномицетов рода ii семейство i 
7.1. Новые виды ii i, i и подвид
. vii ii. 
7.2. Видоспецифичностъ состава и строения тейхоевых кислот
у актиномицетов рода ii 
ГЛАВА 8. Систематика актиномицетов рода ii семейство ii 
8.1. Уточнение границ и диагнозов известных видов рода ii, характеризующихся наличием мицелия. 
8. 2. Новый вид мицелиальных организмов ii i . v 
ГЛАВА 9. Систематика актиномицетов рода семейство . 
9.1. Новый вид i. 
ГЛАВА . Систематика актиномицетов семейства 
.1. Состояние систематики группы к началу исследований. 
.2. iii . v., . v. новые род и вид семейства 
.3. Изучение возможности использования строения тейхоевых кислот клеточных стенок для уточнения таксономической структуры рода 
.3.1. Группа видов viii. 
.3.2. Кластервид i vii 
.3.3. Кластервид v 
.3.4. Кластервид vii 
.3.5. Кластервиды ixiii и 5. i. 
ГЛАВА . Распространение тейхоевых кислот клеточных стенок у организмов
различных таксонов порядка i. 
ГЛАВА . Ассоциации исследованных микроорганизмов с растениями
и нематодами. 
.1. Актинобактериальнонематодные комплексы 
.2. xi . сапротрофы и эндофиты. 
.3. . возбудители паршы картофеля . 
ЗАКЛЮЧЕНИЕ 
ВЫВОДЫ 
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ


Появились сведения о том, что у нокардий фрагментация мицелия может быть выражена в различной степени, что на гифах их субстратного и воздушного мицелия могут формироваться экзоспоры, подобно стрептомицетам Соина с соавт. Нестеренко, , а стрептомицеты часто образуют неспорулирующие или нокардиоподобные мутанты Никитина с соавт. Кузнецов, , Калакуцкий, Никитина, Никитина с соавт. Широко известен факт о потере способности образовывать спорангии культурами актиноплан и франкий . То же можно сказать и в отношении морфологических признаков коринефрмных актином и иегов. Расширение круга изолированных и изученных культур показало, что признаки, характеризующие ранее отдельные роды, свойственны и представителям других родов, например, тип обособления клеток простой, сгибающийся i и раскалывающийся i. Одинаковые типы скользящего роста дочерних клеток найдены у видов и , i и i, и i. И почкование, и бинарное деление, как способы размножения клеток, выявлены у представителей родов , vii, i Нестеренко, Нестеренко с соавт . Подвижность клеток, число Ж1утиков также могут варьировать у штаммов одного рода и зависеть от условий культивирования Аристархова, , , , . Использование электронномикроскопических методов и изучение тонкого строения актиномицетов и коринеподобных бактерий позволили выделить новые признаки для систематики и идентификации соответствующих групп бактерий. Таковыми явились характеристики поверхности спор, используемые в диагностике видов стрептомицетов Преображенская с соавт. Гаузе с соавт. Благодаря электронной микроскопии, у некоторых актиномицетов были обнаружены эндоспоры, ранее описанные у представителей бацилл и клостридий . Этот факт послужил главной причиной выделения i . В настоящее время род не относится к классу ii. В таксономической характеристике родов, образующих споры в цепочках, нашли применение также сведения о временной и пространственной регуляции в закладке септ. Так, септы могут закладываться в два этапа, с небольшими интервалами . Отмечался также каскадный тип спорообразования ii , . У некоторых актиномицетов i септы формируются последовательно в акропетальном направлении , , или базипетальном i Агре с соавт. У других актиномицетов x . Агре, Гузева, . Почти все из описанных выше особенностей споруляционных септ были обнаружены у представителей рода Калакуцкий, Агре, . Для коринеформных актиномицетов также были выявлены особенности ультраструктуры клеток, которые можно использовать в систематике Нестеренко, . К таким признакам автор относит наличие капсулоподобного покрова внешнего слоя стенки, сходного с наружной мембраной, наличие структур типа микрокапсулы, множественное септирование клеток и формирование извилистых септ и септ под углом к продольной оси клетки, деление с помощью расщепления септ и перетяжек, тонкое строение клеточных стенок и некоторые другие характеристики. ГГ 
Несмотря на значительные успехи, цитологическое изучение культур, за исключением отдельных случаев, не дали много сведений, реально пригодных для таксономических построений. Приводимые при описании новых родов электронные фотографии пока служат скорее иллюстрациями, чем активно работающим таксономическим материалом. Хемотаксономическое направление в систематике гг. Изучение и использование в системаитке химического состава клетки и клеточной стенки важный шаг на пути развития системы группы гг. XX в Начало хемотаксономическому направлению в систематике актиномицетов положили работы по определению состава аминокислот и сахаров клеточной стенки Признак несет информацию о специфических для определенных групп актиномицетов компонетах клеточной стенки. Уже в ранних работах i, i, , , , i, . Интенсивное изучение состава клеточной стенки у актиномицетов vi, vi, а,б,в способствовало формированию изменению взглядов на структуру порядка и в значительной степени прогнозировало группировку многих родов, принятую в настоящее время. Так, было указано на хемотаксономические различия двух групп актиномицетов. IV типом клеточной стенки vi Т vi, в vi . Отдельные авторы пытались использовать рассматриваемый признак и для определения филогенетических отношений актиномицетов и коринеподобных бактерий , .